生物育种研究中心立足安徽省农业生产实际和市场需求，围绕本省生物种质改良和技术革新关键科技问题，聚焦重要经济性状遗传基础、环境适应性的分子改良和农业生物分子设计育种3个前沿研究领域，以本省主要农作物、园艺作物、经济动物、林木、微生物为主要研究对象，通过强化源头创新，加强基因编辑核心技术攻关，致力于破解生物分子设计育种关键技术难题，攻克种源卡脖子技术瓶颈，实现高产优质和环境友好型农作物新品种的精准培育，在抗病耐逆能力强、增产潜力大、综合性状优、适合安徽生态环境的专用作物品种上实现突破。此外，中心将针对安徽省园艺种业竞争力弱，高端种苗依赖进口，园艺作物育种技术落后，优质、抗逆的园艺作物新品种匮乏，安徽省猪、牛、羊等畜禽在产量和品质提升面临的畜禽良种精准选育等重大科技问题，加快构建精准的分子设计育种体系，打造国内一流、省内领先的畜禽生物育种技术一体化平台，下大力气做好“粮头食尾”“畜头肉尾”“农头工尾”增值文章。